報(bào)告題目:面向異構(gòu)計(jì)算平臺(tái)的高性能大規(guī)模生物序列分析算法關(guān)鍵技術(shù)研究
報(bào) 告 人:劉衛(wèi)國(guó) 教授
報(bào)告時(shí)間:3月14日(周三)14:30
報(bào)告地點(diǎn):文理大樓804
報(bào)告人簡(jiǎn)介:
劉衛(wèi)國(guó),教授,博士生導(dǎo)師,山東省泰山學(xué)者,擔(dān)任山東大學(xué)計(jì)算機(jī)學(xué)院高性能計(jì)算與大數(shù)據(jù)處理學(xué)科組負(fù)責(zé)人。主要研究領(lǐng)域?yàn)楫悩?gòu)高性能計(jì)算、生物信息學(xué)、大數(shù)據(jù)處理。在高水平國(guó)際期刊如IEEE TPDS, IEEE TITB, JCB, PRL, CPC, BMC Bioinformatics和著名國(guó)際會(huì)議如SC, IPDPS, ICPP, BIBM,EuroPar, Cluster, HiPC上發(fā)表學(xué)術(shù)論文50余篇。擔(dān)任多個(gè)國(guó)際期刊審稿人和國(guó)際會(huì)議程序委員會(huì)委員。其科研成果兩次獲得德國(guó)Fraunhofer IGD的最佳論文一等獎(jiǎng),2016 CCF高性能計(jì)算學(xué)術(shù)會(huì)議最佳論文獎(jiǎng),2017年“戈登?貝爾”獎(jiǎng)。目前是中國(guó)計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)會(huì)員,高性能計(jì)算專業(yè)委員會(huì)委員,生物信息專業(yè)組委員。
報(bào)告摘要:
近年來異構(gòu)計(jì)算平臺(tái)被廣泛應(yīng)用于解決生物序列數(shù)據(jù)分析問題,然而已有的工作缺乏針對(duì)不同處理器的通用性;此外大多數(shù)工作主要集中在針對(duì)小規(guī)模數(shù)據(jù)的簡(jiǎn)單并行算法設(shè)計(jì),缺乏對(duì)異構(gòu)平臺(tái)上不同處理器之間如何協(xié)同計(jì)算進(jìn)而解決大規(guī)模生物序列數(shù)據(jù)分析問題的深入探討;并且現(xiàn)有的工作缺少針對(duì)異構(gòu)超級(jí)計(jì)算平臺(tái)上算法規(guī)模擴(kuò)展性的深入研究。本報(bào)告圍繞上述問題,研究基于異構(gòu)計(jì)算平臺(tái)上的通用可擴(kuò)展大規(guī)模生物序列分析算法設(shè)計(jì)理論和方法,研究成果將為大規(guī)模高性能生物序列數(shù)據(jù)分析的學(xué)術(shù)研究與技術(shù)應(yīng)用打下重要基礎(chǔ)。