題目:大數據驅動的小麥-白粉菌相互作用機制解析初探
主講:賀飛 研究員
時間:4月12日 14:30
地點:學實樓601
主講人簡介:
賀飛,中科院遺傳與發育生物學研究所研究員,中科院-英國約翰·英納斯中心(JIC)植物和微生物聯合研究中心(CEPAMS)課題組組長。本科畢業于西南大學農學與生命科學學院,2011年在中國農業大學生物學院獲得生物信息學博士學位,先后在美國斯隆凱特琳癌癥中心、布魯克海文國家實驗室、堪薩斯州立大學從事博士后研究。長期從事生物信息學與農作物基因組學研究。
由專性活體寄生的白粉菌 (Bgt, Blumeria graminins f. sp. tritici)引起的白粉病,嚴重威脅著中國的小麥生產。發掘小麥中的白粉病抗性基因(R基因)和Bgt中相應的無毒基因(Avr基因),以及了解它們之間相互作用的分子機制,有助于開發新的白粉病防治手段。到目前為止,已克隆的R基因和Avr基因數量有限,阻礙了我們對它們之間分子識別機制的理解。賀飛博士搭建了小麥-白粉菌相互作用表型篩查平臺,完成了對100多份小麥白粉菌小種的基因組測序工作,已進行500份小麥與100份白粉小種的相互作用表型鑒定工作,通過雙向全基因組關聯研究(biGWAS)快速挖掘R-Avr互作。結合現有的基因型數據和表型數據,進行了跨物種的GWAS初步分析,結果表明該策略可以鑒定出已知和未知的R/Avr基因。