題目:宏基因組數據分析和科學傳播
主講:劉永鑫 研究員
時間:6月19日9:00
地點:國重樓一樓報告廳
主講人簡介:劉永鑫,中國農科院基因組所研究員,iMeta期刊執行主編,宏基因組公眾號創始人。主要研究方向為微生物組研究方法、功能研究和科學傳播,在Science、iMeta、Nature Biotechnology、Nature Microbiology、Cell Host & Microbe等期刊發表論文50余篇,被引13000余次。主編《微生物組實驗手冊》專著,由300多位同行參與,共同打造本領域長期更新的中文百科全書。創辦宏基因組公眾號,15萬+同行關注,累計閱讀量超3千萬次,打造本領域最具影響的科學傳播平臺,免費為您團隊發布成果、方法、經驗、招聘信息,歡迎投稿。發起iMeta期刊,打造微生物組/生物信息領域國際頂刊,解決我本領域期刊出版卡脖子問題,建立國際學術話語權體系。
報告內容簡介: 宏基因組技術改變了人們認識世界的方式,使我們可以全面揭示生活在人、動物、植物和環境中微生物組的全貌。我們在團隊在技術方法方向,開發了培養組(Culturome, Nature Protocols, 2021)、擴增子(EasyAmplicon, iMeta, 2023)、宏基因組(EasyMetagenome)等分析流程,可視化平臺ImageGP、EVenn和網絡分析R包ggClusterNet。在功能研究方向,發現了萜類化合物對微生物組的調控規律(Science, SCLS, 2019)、宿主關鍵基因介導根系微生物組參與氮利用(Nature Biotechnology, 2019)和微生物組在抗赤霉病中的機制和應用(Nature Microbiology, 2022)。在科學傳播方向,創辦《宏基因組公眾號》為本領域分享研究方法、成果解讀博文3000余篇;打造本領域方法專著《微生物組實驗手冊》,打造本領域研究的基礎設施;發起了首本微生物組和生物信息交叉期刊《iMeta》,預計IF > 20,建立我國主導的國際學術話語權體系。