近日,山東農(nóng)業(yè)大學(xué)萬(wàn)勇善/劉風(fēng)珍團(tuán)隊(duì)在Plant Biotechnology Journal在線發(fā)表了題為“Fine mapping of qAHPS07and functional studies of AhRUVBL2controlling pod size in peanut (Arachis hypogaeaL.)”的研究論文。該研究發(fā)現(xiàn)了調(diào)控花生莢果大小的關(guān)鍵基因AhRUVBL2,為解析花生莢果大小的分子調(diào)控機(jī)制提供了科學(xué)依據(jù),也為花生莢果大小遺傳改良提供了分子標(biāo)記。
花生莢果大小是決定單位面積產(chǎn)量的關(guān)鍵因素之一,也是衡量其商品特性的重要指標(biāo),挖掘其關(guān)鍵基因?qū)μ剿髑v果大小發(fā)育的調(diào)控機(jī)理以及花生高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)分子育種具有重要的理論意義和應(yīng)用價(jià)值。
該研究以莢果大小差異顯著的花生品種(系)79266(普通果)和D893(特大果)為材料,研究發(fā)現(xiàn)果殼橫截面細(xì)胞層數(shù)是造成二者莢果大小差異的主要原因。利用其雜交F2群體、RIL群體以及次級(jí)F2群體將莢果大小主效QTL-qAHPS07精細(xì)定位在Arahy.07: 424670 bp~461129 bp,物理區(qū)間36.46 kb(圖1)。該區(qū)間包含了6個(gè)注釋基因,根據(jù)基因組重測(cè)序結(jié)果和基因表達(dá)特征分析,推測(cè)RUVBL2蛋白編碼基因?yàn)閝AHPS07的候選基因。RUVBL2在動(dòng)物和細(xì)菌中研究較多,RUVBL2蛋白序列的結(jié)構(gòu)域序列在物種間高度保守,具有依賴(lài)于ATP的DNA解旋酶功能,參與ATP結(jié)合、DNA損傷反應(yīng)、細(xì)胞凋亡和調(diào)控細(xì)胞分裂等生物學(xué)過(guò)程。
圖1 BSA-seq分析與qAHPS07的精細(xì)定位
79266和D893在AhRUVBL2的編碼區(qū)無(wú)堿基差異,啟動(dòng)子區(qū)域存在3個(gè)SNP,分別為SNP_460907(G/A),SNP_461023(A/T)和SNP_461129(C/T),在D893的果殼中AhRUVBL2的表達(dá)量顯著高于79266。將35S啟動(dòng)子與AhRUVBL2的cDNA連接轉(zhuǎn)化擬南芥,過(guò)表達(dá)AhRUVBL2的轉(zhuǎn)基因植株生長(zhǎng)健壯、葉片、角果和種子明顯增大(圖2)。利用花生VIGS體系,在D893幼苗中沉默AhRUVBL2,沉默株生長(zhǎng)遲緩,生物量、主莖高、葉長(zhǎng)、葉寬和側(cè)根長(zhǎng)均顯著低于野生型(圖3)。
圖2 AhRUVBL2過(guò)表達(dá)擬南芥角果和種子的表型分析
圖3 AhRUVBL2沉默花生株系的表型分析
在119份花生栽培種種質(zhì)中,AhRUVBL2啟動(dòng)子區(qū)的SNP_460907,SNP_461023和SNP_461129與莢果大小顯著相關(guān)。這3個(gè)SNP將119份種質(zhì)分為3種單倍型,其中Hap_GAC種質(zhì)78份,Hap_ATT種質(zhì)38份,Hap_GAT種質(zhì)3份。Hap_ATT種質(zhì)的單果重、單仁重、單株果重和單株仁重均顯著大于Hap_GAC種質(zhì)。SNP_461129已成功開(kāi)發(fā)為KASP標(biāo)記(專(zhuān)利申請(qǐng)?zhí)枺?02110359658.1),可用于花生莢果大小性狀遺傳改良中AhRUVBL2的基因型選擇。
山東農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院博士研究生楊會(huì)和駱璐副教授為該文的共同第一作者。劉風(fēng)珍教授和萬(wàn)勇善教授為共同通訊作者。該研究得到了國(guó)家自然科學(xué)基金、山東省農(nóng)業(yè)良種工程和山東省花生產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系項(xiàng)目的資助。
論文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.14076
編 輯:萬(wàn) 千
審 核:賈 波